AppleとVisaは、Apple Payの中核技術の所有権を争う訴訟の無効化を目指していたが、その試みは失敗に終わった。Law360の報道によると、連邦巡回控訴裁判所は、一連の判例に基づかない判決の中で、AppleとVisaの上訴を棄却した（記事全文を読むには購読が必要）。
2017年、ボストン地域の「イネーブリングテクノロジー」企業であるユニバーサルセキュアレジストリは、デラウェア州連邦地方裁判所に、AppleとVisaがモバイル決済プラットフォームの基盤となる電子決済と身元認証の特許を侵害しているとして訴訟を起こした。
訴訟では損害賠償額は特定されていないものの、侵害の範囲を詳細に述べており、「2014年以来、AppleのバックエンドサーバーとVisaの決済処理ネットワークVisaNet（Visaトークンサービスを含む）は、米国で行われた数十億件のApple Pay取引を含む、Apple Payを使った取引をサポートし、処理してきた」と主張している。
2017年の訴状によると、「AppleのCEO、ティム・クック氏は2014年9月のiPhone 6発表イベントで、『決済は巨大なビジネスです。クレジットとデビットカードで毎日120億ドルを費やしています。これは年間4兆ドルを超え、これは米国だけでの数字です。そして、このビジネスは1日2億件以上の取引で構成されています』と述べました。」
USRは、13件の米国特許に加え、2000年以降にワイス氏が取得した出願中特許および外国特許を保有しているとされています。これらの特許は、安全で確実な本人認証を可能にするソフトウェアアプリケーションに焦点を当てています。これには、決済、安全な金融取引、物理アクセス、そしてワイス氏が開発したSecurIDトークンの代替品などが含まれます。
